一、DNA微阵列方法与应用（论文文献综述）
王晓红[1]（2021）在《PCR荧光探针法联合DNA微阵列芯片法检测在肺结核诊断和治疗中的应用》文中进行了进一步梳理目的探讨PCR荧光探针法联合DNA微阵列芯片法检测在肺结核诊断和治疗中的应用效果。方法选取2020年1月至10月上饶市第二人民医院收治的128例肺结核患者为观察组,另外选取同期40例非肺结核患者为对照组,留取两组对象晨痰,采用痰涂片抗酸染色、血清结核抗体及PCR荧光探针法进行结核分枝杆菌检测,再采用DNA微阵列芯片法将PCR荧光探针法检出结核分枝杆菌的痰液进行结核耐药性检测,比较三种方法的诊断效能,统计DNA微阵列芯片法检测利福平和异烟肼耐药性结果。结果 PCR荧光探针法诊断肺结核的灵敏度、特异度、阳性预测值、准确度高于痰涂片抗酸染色、血清结核抗体检测,差异有统计学意义（P<0.05）;应用DNA微阵列芯片法检出利福平敏感45例,耐药11例;异烟肼敏感44例,耐药12例;双重耐药5例。结论 PCR荧光探针法联合DNA微阵列芯片法既能提高结核分枝杆菌的阳性率,也能快速检测结核分枝杆菌的耐药性,检测速度快,48 h即可获得诊断及耐药结果,可以协助早期诊断,制定有效的治疗方案,对改善肺结核患者预后具有重要意义。
余茜,闻轶旸,高志琴,杨连娟[2]（2021）在《DNA微阵列芯片在皮肤分枝杆菌感染中的早期诊断价值》文中指出目的研究DNA微阵列芯片在皮肤分枝杆菌感染早期诊断中的临床应用价值。方法应用传统方法（包括病理学以及培养和测序鉴定）和DNA微阵列芯片技术对6例临床疑似皮肤分枝杆菌感染患者的皮肤组织进行检测。结果 6例患者的发病诱因多有海鲜接触史或外伤史,表现为单发或是呈淋巴管样排列模式;传统的细菌培养有5例患者阳性,经过测序鉴定分别为海分枝杆菌4例、龟分枝杆菌1例;DNA微阵列芯片技术检测6例患者均为阳性,其中海分枝杆菌5例,龟分枝杆菌1例;DNA微阵列芯片技术阳性率（6/6）高于传统的培养技术（5/6）,此外检测时间也远低于传统培养技术。结论DNA微阵列芯片技术具有简便、快速、高敏感等特点,可鉴定皮肤分枝杆菌感染的致病菌种,为临床做出早期诊断和治疗提供依据。
杨建伟,李辉,王少华,杨卫华,杨俊梅[3]（2021）在《间隔区寡核苷酸DNA微阵列分型在结核分枝杆菌检测中的应用》文中研究说明目的探讨间隔区寡核苷酸DNA微阵列法在结核分枝杆菌基因分型检测中的应用价值。方法将结核分枝杆菌标准菌株（H37Rv）、卡介苗（BCG）菌株和97株临床结核分枝杆菌株的聚合酶链反应产物分别进行传统Spoligotyping和间隔区寡核苷酸DNA微阵列分型,比较2种方法的一致性,并用H37Rv菌株检测间隔区寡核苷酸DNA微阵列法的灵敏度。结果结核分枝杆菌标准菌株、BCG菌株和97株临床结核分枝杆菌菌株的间隔区寡核苷酸DNA微阵列分型结果与传统Spoligotyping完全一致,符合率为100%;且间隔区寡核苷酸DNA微阵列法有较好的检测效能。结论间隔区寡核苷酸DNA微阵列法用于结核分枝杆菌分型具有操作简便、快速等特点,适于结核病的溯源和分子流行病学调查。
王锐[4]（2021）在《微流控芯片技术结合多重PCR-反向斑点杂交原理同时检测24种人乳头瘤病毒基因型的方法学研究》文中进行了进一步梳理研究背景:人乳头瘤病毒（HPV）目前已鉴定出超120种基因型,不同基因型能引起不同的临床表征。对于HPV的检测,临床上传统方法大多采用血清学方法、巴氏涂片、液基细胞薄层技术等检测方法,操作复杂,主观性大,结果缺乏准确性,特异性和灵敏性都不够理想,为HPV的临床诊断治疗带来很大困难。随着分子诊断技术的不断发展,以核酸探针杂交的分子生物技术成为HPV分型检测的主流方式,而基于微阵列的反向杂交技术在HPV分型检测方面的应用与传统方法相比,具有更高的灵敏性和特异性,可以同时用于多个样本和多种基因型分型。近年来,微流控技术在分子诊断领域的应用得到长足发展。将微阵列试验所需的多种设备功能整合到一块手掌大小的芯片上,微流控与微阵列的技术结合可实现较少的样本和试剂的使用量和减少孵育所需时间,且纳米溶液体积微通道中的高表面积体积比极大地提高了检测灵敏度。本研究构建了一种集成样本核酸提取、多聚酶链式反应（PCR）扩增、基于微阵列的反向斑点杂交和结果分析功能的手掌大小的微流控芯片,其可对样品中24种HPV基因型同时进行检测。目的:将传统HPV基因型检测所需的样本核酸提取、目的核酸扩增、扩增产物分析步骤集成在本研究所提出的微流控芯片上进行,同时可一次性检测24种HPV基因型。此外,对其检测过程进行优化,并对优化后的微流控芯片的检测性能进行实验评估。方法:（1）微流控芯片设计与制作:以聚苯乙烯为原材料制作微流控芯片主体,层压上用以多重PCR扩增的PCR联排管,嵌入包含24种HPV基因型检测探针的微阵列用以反向斑点杂交检测,从而对HPV临床样本进行24种HPV基因型的检测。（2）以24种HPV基因序列中L1区的保守序列设计扩增引物和检测探针,对各基因型上下游引物进行简并,确定8条上游引物和7条下游引物,在引物3’端预先以生物素标记,检测探针则用于制作DNA微阵列。（3）收集2019年5月至2021年1月中国科学技术大学附属第一医院检验科110例宫颈疾病门诊患者的宫颈拭子样本,且所有样本均在患者未进行任何治疗前收集。（4）筛选以PRD和PCRD驱动的泵液通路,计算多次泵液总量并在同一芯片不同芯片单位相同泵液途径进行对比,计算微泵的总体泵液偏差以评估该微流控系统的泵液精度。（5）以3种不同磁珠在微流控芯片上进行核酸提取步骤,对提取核酸进行定量PCR检测,对比核酸提取效率确定提取效率最高的磁珠种类。（6）以不同浓度的两种不同修饰的HPV16基因型探针制作微阵列,在不同杂交温度和时间的条件下进行杂交过程以优化杂交条件,并以不同浓度的HPV16核酸样本进行杂交过程以测算杂交灵敏度。（7）将24种HPV基因型国家标准参考品梯度稀释为不同浓度与HEK293细胞混合作为模拟样本以测试该芯片的检测限。（8）使用该微流控系统和经过中国国家药品监督管理局批准的同类检测试剂盒分别对150例临床样本进行检测,并比较两种检测方法的检测结果以评估该微流控系统的临床应用表现。结果:在本研究构建的微流控芯片上,以化学细胞裂解和硅基磁珠吸附核酸的原理提取样本核酸,加入引物开始扩增循环,扩增产物在95℃条件下解链成单链DNA与DNA微阵列在45℃条件下杂交10分钟,最后加入显色液进行显色反应,根据显色结果判断检测结果。（1）筛选的PRD泵液通路为RR-SR,PCRD泵液通路为ER-MM1,经测算PRD的泵液总体CV为15.97%,PCRD的总体CV为21.55%。（2）使用3种不同品牌磁珠提取的核酸经RT-PCR定量检测对比,Magsibeads-Allround在微流控芯片中的提取效率最高（65±5%）。（3）在45℃条件下杂交10分钟为最优条件,在该微流控芯片进行反向斑点杂交的杂交灵敏度为100Pm。此外制作微阵列的探针浓度越高,杂交结果越好,而两种不同修饰探针的杂交结果没有明显差异。（4）使用含有不同浓度24种HPV基因型质粒的模拟样本进行检测,测算出该微流控芯片的最低检测限为103copies/m L。（5）通过与经国家药监局批准的人乳头瘤病毒检测试剂盒检测结果对比,检测结果一致,显示该微流控系统可应用于临床样本检测。结论:本研究构建的微流控芯片集成了样本核酸提取、目的核酸扩增、反向斑点杂交和结果分析功能,对于24种HPV基因型的检测具有较高的检测灵敏度,同相同类型的试剂盒产品对比,表明该芯片具有应用于临床样本检测的潜力。
窦敏[5]（2020）在《DNA微阵列芯片法检测结核分枝杆菌利福平耐药基因的价值研究》文中提出研究目的:采用DNA微阵列芯片法检测结核分枝杆菌利福平耐药基因,为临床诊治提供实验依据。研究方法:收集整理青岛市胸科医院2018年7月1日-2019年12月31日结核科收住的痰涂片阳性的肺结核患者,同时行传统痰结核分枝杆菌培养及药敏试验、DNA微阵列芯片法检测结核分枝杆菌的耐药性,且两项均有阳性结果回复的患者。所有患者入院后均留取晨痰2份分别送检进行传统痰结核分枝杆菌培养及药敏、DNA微阵列芯片法检测。传统培养及药敏采用改良罗氏培养法及菌种初步鉴定,并行比例法抗结核药物敏感性试验。以传统培养及药敏试验结果为金标准。DNA微阵列芯片法与传统结核分枝杆菌培养及药敏试验对利福平耐药性监测结果进行比较;对耐多药检测结果进行比较;总结基因位点突变情况。研究结果:1.对入选的416例患者的样本结果进行比较,以传统培养及药敏试验结果为金标准,DNA微阵列芯片法检测利福平耐药的敏感度为84.3 1%,特异度为99.18%,一致率为97.36%,阳性预测值为93.48%,阴性预测值为97.84%。X2=1.45,P>0.05。对两组的利福平耐药性监测情况进行比较,不具有明显的差异。2.我们在DNA微阵列芯片法中共检测出基因突变46例,其中真耐药43例,假耐药3例。真耐药中有36例发生rpoB 531位点突变,突变率78.26%;4例发生rpoB 526位点突变,1例发生rpoB 516位点突变,1例发生rpoB 511和rpoB 516同时突变,1例发生rpoB 511和rpoB 526同时突变。假耐药的3例中,1例发生rpoB516位点突变,2例发生rpoB 511位点突变。3.对入选的416例患者的样本结果进行比较,以传统培养及药敏试验结果为金标准,DNA微阵列芯片法检测耐多药结果的敏感度为89.29%,特异度为80.00%,一致率为81.67%,阳性预测值为80.65%,阴性预测值为88.89%。研究结论:通过对DNA微阵列芯片法检测结核分枝杆菌利福平耐药基因的效果评价,证实此检测方法具有较高的敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值,与传统的结核分枝杆菌培养药敏试验一致率高。而且该方法检测时间短,结果可靠,价格相对经济,值得被应用于临床结核病耐药的诊断及指导耐药方案的调整。
刘晓光[6]（2020）在《基于DNA微阵列数据的密度峰值聚类算法研究与应用》文中研究表明在生物信息学领域中,通过对肿瘤样本的DNA微阵列数据进行聚类分析,来划分不同的肿瘤类型或亚型一直是研究的重点。利用DNA微阵列数据在分子层面上对肿瘤进行分析,不仅可以根据同一种肿瘤样本相关致病基因的不同表达区分不同的肿瘤亚型。还可以对未知亚型的部分肿瘤进行亚型的预测以及分类。而由于基因本身的特点以及DNA微阵列技术高成本的原因,DNA微阵列数据集大多呈现出高维度、小样本的特点。2014年在Science上提出的密度峰值聚类算法（Density Peak Clustering,DPC）由于其参数简单,聚类准确率较高的优点受到各个领域的广泛认可,具有很高的研究价值。本文主要针对DNA微阵列数据集的特点,以密度峰值聚类算法的改进为研究方向。并将改进后的算法应用在DNA微阵列数据集上进行肿瘤亚型的聚类研究。主要研究内容有:（1）为了解决DPC算法人为参与关键性参数的选取的问题,本文采用将DPC算法和智能优化算法相结合的方式进行改进。算法将蝙蝠算法（Bat Algorithm,BA）和DPC算法相结合。首先对蝙蝠优化算法搜索后期收敛速度变慢,易陷入局部最优的缺点加以改进。将自适应惯性权重加入到BA的速度更新公式中。然后通过聚类算法的内评价指标作为适应度函数运用改进后BA对DPC算法关键性参数进行合理选取。同时对初始聚类中心点的选取方式加以改进。通过实验对比,来验证方法的有效性。（2）为了改进DPC算法在高维复杂数据集上表现不佳以及非聚类中心点的分配策略过于简单的问题,同时也为在DNA微阵列数据集上的应用打下基础。本文采用将DPC算法和熵加权软子空间聚类算法（Entropy Weighting K-means Algorithm for Subspace Clustering,EWKM）相结合的方式进行改进。算法利用EWKM较强的高维复杂数据处理能力以及非聚类中心点分配策略的合理性,将两种算法的优势相结合,同时避免两种算法的缺陷。利用DPC算法进行初始聚类中心点的选取,同时利用EWKM算法进行后续数据点的分配来对算法加以改进。通过实验对比,来验证方法的有效性。（3）将本文提出的算法应用在肿瘤亚型聚类领域中。首先对DNA微阵列数据集进行预处理,剔除与肿瘤发病无关的基因的影响。然后将本文提出算法应用在DNA微阵列数据集上,通过探究基因的差异表达探究肿瘤不同亚型的聚类。通过实验对比,证明了算法能够通过对不同基因的差异表达的分析精确地对肿瘤亚型进行聚类,在实际应用领域具有重要意义。
单永梅,王伟炳,王建美[7]（2018）在《DNA微阵列芯片法在耐药结核分枝杆菌检测中的准确性和应用价值》文中研究表明目的描述DNA微阵列芯片法对结核分枝杆菌的检出情况,评价该方法对异烟肼和利福平的检测效果。方法利用传统罗氏培养及比例法药敏试验和DNA微阵列芯片法,同时对江苏省灌云县疾病预防控制中心2011年1月至2017年5月登记的814例涂阳肺结核患者的痰标本进行结核分枝杆菌的检出与异烟肼和利福平耐药检测,以传统罗氏培养及比例法药敏试验为金标准,对DNA微阵列芯片法的检测效果进行评价。结果对登记的814例涂阳肺结核患者的痰标本进行结核分枝杆菌的检出,与传统罗氏培养法相比,DNA微阵列芯片法对涂阳肺结核患者的结核分枝杆菌检出情况存在统计学差异（P<0.05）,检出率为86.1%（701/814）,高于传统罗氏培养的检出率82.4%（671/814）;分层分析结果显示:DNA微阵列芯片法对初治涂阳肺结核患者的结核分枝杆菌检出情况无统计学差异（P> 0.05）,对复治涂阳肺结核患者的结核分枝杆菌检出情况存在统计学差异（P <0.05）,检出率为79.5%（171/215）,高于传统罗氏培养的检出率65.6%（141/215）。对有完整的异烟肼和利福平耐药检测结果的620例患者分析结果显示,与比例法药敏试验相比,DNA微阵列芯片法对结核分枝杆菌的异烟肼和利福平耐药性的检测效果均无统计学差异,所有检测结果的特异度均> 95.0%,阴性预测值均> 90.0%。结论 DNA微阵列芯片法对结核分枝杆菌的检出情况与传统罗氏培养存在统计学差异,检出率高于传统罗氏培养,同时该法对异烟肼和利福平耐药性的检测效果理想,真实性可靠性较好,在结核病防治工作中具有较好的应用价值。
徐微[8]（2018）在《DNA-微阵列芯片法检验结核与非结核分枝杆菌的临床应用价值》文中进行了进一步梳理目的探讨DNA-微阵列芯片法检验结核与非结核分枝杆菌的临床应用价值。方法选择2016年12月—2018年3月该院痰结核培养或结核分杆菌痰涂片阳性标本108份。108份标本均采用改良罗氏培养法、DNA-微阵列芯片法检验,对二者检验结果不一致的标本进行测序检验,并将结果作为检验的金标准。评价改良罗氏法、DNA-微阵列芯片法对结核与非结核分枝杆菌的鉴别效果。结果改良罗氏培养法对结核分枝杆菌与非结核分枝杆菌检验的准确率为96.15%、97.56%,与DNA-微阵列芯片92.31%、96.34%对比差异无统计学意义（χ2=0.253、0.265,P>0.05）。结论 DNA-微阵列芯片法在结核与非结核分枝杆菌检验中具有较高的准确率,且操作简便、快速,临床应用价值显着。
李小鹏[9]（2018）在《基于改进的svm的基因微阵列数据疾病预报》文中研究指明DNA微阵列又称DNA芯片,是上个世纪生物领域重要的发明之一。他使同时监控成千上万个基因的表达成为了可能。随着现代生活的发展,疾病诊断成为了医学很重要的一部分。本文研究利用DNA微阵列技术来做疾病诊断预测。DNA微阵列数据集有低样本,高维度,高冗余,高噪音的特点,不能直接利用机器学习的算法进行分类。本文首先对数据集进行了预处理,然后利用gs,cho’s,svm-rfe等方法进行特征提取,将基因打分,得出特征基因的排序。利用选出的基因再结合数据的特点,本文选择了使用改进的支持向量机,最小二乘向量机进行模型的训练。模型有两个重要参数,参数的选择对分类器的好坏有至关重要的影响。本文使用了遗传算法对参数优化,提高了模型的预报能力。在白血病,胶质癌,弥漫性大b淋巴癌的数据集上进行了预报测试。在白血病的数据中,取得了只用4个基因,预报准确率100%的结果,优于其他方法。本文最后还指出DNA微阵列的特征提取的现实意义,特征提取对生物学和医学的病理上的研究有一定的指导作用。
张建军,张天成,隋宇婷,岳德君[10]（2014）在《基于极限学习机（ELM）岭回归的DNA微阵列数据填补》文中提出近年来,生物学领域中DNA微阵列技术发展迅速,利用微阵列数据可以有效地提取生物学信息,其应用十分广泛.但是微阵列试验中存在的许多客观因素,使得基因表达数据常常出现缺失.针对传统的缺失数据填补方法没有考虑微阵列数据中存在相关性的问题,提出一种基于ELM岭回归（BELM）的方法来对DNA微阵列数据进行填补.算法在考虑微阵列数据相关性的同时,解决了ELM前馈神经网络中存在的复共线性问题.为了进一步提高数据填补的效果,采用广义交叉验证算法确定最佳岭参数.最后,采用真实数据集,以均方误差作为评估标准对算法进行了验证,并将其与相关算法进行比较.结果表明,该算法在DNA微阵列缺失数据填补方面具有更高的准确率.
二、DNA微阵列方法与应用（论文开题报告）
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、DNA微阵列方法与应用（论文提纲范文）
（1）PCR荧光探针法联合DNA微阵列芯片法检测在肺结核诊断和治疗中的应用（论文提纲范文）
| 1 资料与方法 |
| 1.1 一般资料 |
| 1.2 检测方法 |
| 1.3 观察指标及评价标准 |
| 1.4 统计学方法 |
| 2 结果 |
| 2.1 痰涂片抗酸染色、血清结核抗体及PCR荧光探针法检测结果及诊断效能比较 |
| 2.2 DNA微阵列芯片法检测利福平和异烟肼耐药性的结果 |
| 3 讨论 |
（2）DNA微阵列芯片在皮肤分枝杆菌感染中的早期诊断价值（论文提纲范文）
| 1 资料与方法 |
| 1.1 研究对象 |
| 1.2 仪器与试剂 |
| 1.3 方法 |
| 2 结 果 |
| 2.1 基本资料 |
| 2.2 病理学检查 |
| 2.3 病原学检查 |
| 2.4 DNA微阵列芯片检测结果 |
| 2.5 治疗 |
| 3 讨 论 |
（3）间隔区寡核苷酸DNA微阵列分型在结核分枝杆菌检测中的应用（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 菌株来源 |
| 1.2 试剂与仪器 |
| 1.3 实验方法 |
| 1.3.1 DNA提取 |
| 1.3.2 传统Spoligotyping法分型 |
| 1.3.3 间隔区寡核苷酸DNA微阵列方法分型 |
| 1.3.4灵敏度检测 |
| 1.4 统计学处理 |
| 2 结果 |
| 2.1 传统Spoligotyping法分型结果 |
| 2.2 间隔区寡核苷酸DNA微阵列法分型结果 |
| 2.3 间隔区寡核苷酸DNA微阵列法与Spoligoty-ping法的一致性检验 |
| 2.4 间隔区寡核苷酸DNA微阵列法的灵敏度 |
| 3 讨论 |
（4）微流控芯片技术结合多重PCR-反向斑点杂交原理同时检测24种人乳头瘤病毒基因型的方法学研究（论文提纲范文）
| 英文缩略词表 |
| 中文摘要 |
| Abstract |
| 1 前言 |
| 2 材料与方法 |
| 3 结果 |
| 4 讨论 |
| 5 结论 |
| 6 参考文献 |
| 附录 |
| 致谢 |
| 综述 人乳头瘤病毒与宫颈癌及其检测方法 |
| 参考文献 |
（5）DNA微阵列芯片法检测结核分枝杆菌利福平耐药基因的价值研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| abstract |
| 引言 |
| 第一章 资料和方法 |
| 研究对象 |
| 标本采集 |
| 指标检测 |
| 1.用改良罗氏培养法及菌种初步鉴定,并行比例法抗结核药物敏感性试验 |
| 2.用DNA微阵列芯片法(结核分枝杆菌耐药基因检测试剂盒)检测结核分枝杆菌的耐药性 |
| 统计学分析 |
| 第二章 研究结果 |
| 1.DNA 微阵列芯片法与传统结核分枝杆菌培养及药敏试验对利福平耐药性监测结果的比较 |
| 2.DNA 微阵列芯片法检测利福平耐药基因相关突变位点情况 |
| 3.DNA 微阵列芯片法与传统结核分枝杆菌培养及药敏试验的耐多药检测结果比较 |
| 4. DNA 微阵列芯片法检测耐多药基因相关突变位点情况 |
| 第三章 讨论 |
| 第四章 结论 |
| 参考文献 |
| 综述 |
| 综述参考文献 |
| 攻读学位期间的研究成果 |
| 附录 中英文缩略词对照表 |
| 致谢 |
（6）基于DNA微阵列数据的密度峰值聚类算法研究与应用（论文提纲范文）
| 摘要 |
| Abstract |
| 1 绪论 |
| 1.1 选题背景及研究意义 |
| 1.2 国内外研究现状 |
| 1.2.1 聚类分析技术研究现状 |
| 1.2.2 数据挖掘技术在生物信息学领域的研究现状 |
| 1.3 DNA微阵列数据简介 |
| 1.4 本文主要研究内容及主要创新点 |
| 1.5 本文结构安排 |
| 2 聚类算法及其有效性评价指标 |
| 2.1 聚类分析算法概述 |
| 2.1.1 基于划分的聚类算法 |
| 2.1.2 基于层次的聚类算法 |
| 2.1.3 基于密度的聚类算法 |
| 2.1.4 基于网格的聚类算法 |
| 2.2 密度峰值聚类算法 |
| 2.3 相似性度量方式 |
| 2.4 有效性评价指标 |
| 3 基于蝙蝠算法的密度峰值聚类算法 |
| 3.1 蝙蝠算法 |
| 3.2 蝙蝠算法改进 |
| 3.3 基于蝙蝠算法的密度峰值聚类算法 |
| 3.4 实验与分析 |
| 3.4.1 实验数据与参数设置 |
| 3.4.2 算法性能分析 |
| 3.5 本章小结 |
| 4 熵加权软子空间密度峰值聚类算法 |
| 4.1 熵加权的软子空间聚类算法 |
| 4.2 熵加权软子空间密度峰值聚类算法 |
| 4.3 实验与分析 |
| 4.3.1 实验所用数据集与实验环境 |
| 4.3.2 实验结果与分析 |
| 4.4 本章小结 |
| 5 EWDPC算法在肿瘤亚型聚类上的应用 |
| 5.1 实验所用数据集 |
| 5.2 算法实验 |
| 5.2.1 数据预处理 |
| 5.2.2 算法应用 |
| 5.3 实验结果对比分析 |
| 5.4 本章小结 |
| 6 总结与展望 |
| 6.1 总结 |
| 6.2 展望 |
| 致谢 |
| 参考文献 |
| 攻读学位期间的研究成果 |
（7）DNA微阵列芯片法在耐药结核分枝杆菌检测中的准确性和应用价值（论文提纲范文）
| 材料和方法 |
| 一、研究对象 |
| 二、传统罗氏培养和比例法药敏试验 |
| 1. 菌悬液制备和稀释： |
| 2. 罗氏痰标本培养： |
| 3. 比例法药敏试验： |
| 4. 质量控制： |
| 三、DNA微阵列芯片法 |
| 1. 检测原理： |
| 2. 操作步骤： |
| 3. 质量控制： |
| 四、统计学分析 |
| 结果 |
| 一、结核分枝杆菌检出情况分析 |
| 1. DNA微阵列芯片法对涂阳肺结核患者的结核分枝杆菌检出情况： |
| 2. DNA微阵列芯片法对初治涂阳肺结核患者的结核分枝杆菌检出情况： |
| 3. DNA微阵列芯片法对复治涂阳肺结核患者的结核分枝杆菌检出情况： |
| 二、耐药情况分析 |
| 1.DNA微阵列芯片法检测涂阳肺结核患者耐多药情况的评价结果： |
| 2.DNA微阵列芯片法检测涂阳肺结核患者异烟肼耐药情况的评价结果： |
| 3.DNA微阵列芯片法检测涂阳肺结核患者利福平耐药情况的评价结果： |
| 讨论 |
（8）DNA-微阵列芯片法检验结核与非结核分枝杆菌的临床应用价值（论文提纲范文）
| 1 资料与方法 |
| 1.1 一般资料 |
| 1.2 方法 |
| 1.2.1 主要仪器与试剂 |
| 1.2.2 检验方法 |
| 1.3 观察指标 |
| 1.4 统计方法 |
| 2 结果 |
| 3 讨论 |
（9）基于改进的svm的基因微阵列数据疾病预报（论文提纲范文）
| 致谢 |
| 摘要 |
| Abstract |
| 1. 绪论 |
| 1.1 引言 |
| 1.2 DNA微阵列介绍 |
| 1.2.1 DNA微阵列 |
| 1.2.2 DNA微阵列的数据特点以及应用 |
| 1.3 疾病预报以及国内外的研究现状 |
| 1.4 本文结构与安排 |
| 2. 数据集和特征提取的方法 |
| 2.1 数据集介绍 |
| 2.2 特征提取 |
| 3. 分类器的介绍 |
| 3.1 引言 |
| 3.2 SVM算法介绍 |
| 3.3 KNN算法介绍 |
| 4. 智能算法参数寻优 |
| 4.1 引言 |
| 4.2 遗传算法参数法优化 |
| 4.3 小结与讨论 |
| 5. 总结与展望 |
| 5.1 案例学习 |
| 5.2 全文研究展望 |
| 参考文献 |
（10）基于极限学习机（ELM）岭回归的DNA微阵列数据填补（论文提纲范文）
| 1引言 |
| 2 DNA微阵列 |
| 2.1 DNA微阵列数据的表示 |
| 2.2微阵列缺失数据 |
| 3相关工作 |
| 3.1传统缺失数据填补方法 |
| 3.2基于极限学习机缺失数据填补方法 |
| 3.2.1极限学习机 |
| 3.2.2 ELM基本原理 |
| 3.2.3基于ELM的数据填补算法 |
| 4基于ELM岭回归的DNA微阵列数据填补 |
| 4.1岭回归算法 |
| 4.2利用广义交叉验证法 (GCV) 确定岭回归参数 |
| 4.3基于ELM岭回归的数据填补算法 |
| 5实验结果与分析 |
| 5.1实验数据 |
| 5.2确定最佳隐含层节点数 |
| 5.3准确率与运行速度比较 |
| 5.4准确率与缺失率的关系 |
| 5.5实验结果 |
| 6结束语 |
四、DNA微阵列方法与应用（论文参考文献）
- [1]PCR荧光探针法联合DNA微阵列芯片法检测在肺结核诊断和治疗中的应用[J]. 王晓红. 中国当代医药, 2021(32)
- [2]DNA微阵列芯片在皮肤分枝杆菌感染中的早期诊断价值[J]. 余茜,闻轶旸,高志琴,杨连娟. 中国真菌学杂志, 2021(04)
- [3]间隔区寡核苷酸DNA微阵列分型在结核分枝杆菌检测中的应用[J]. 杨建伟,李辉,王少华,杨卫华,杨俊梅. 新乡医学院学报, 2021(04)
- [4]微流控芯片技术结合多重PCR-反向斑点杂交原理同时检测24种人乳头瘤病毒基因型的方法学研究[D]. 王锐. 安徽医科大学, 2021(01)
- [5]DNA微阵列芯片法检测结核分枝杆菌利福平耐药基因的价值研究[D]. 窦敏. 青岛大学, 2020(01)
- [6]基于DNA微阵列数据的密度峰值聚类算法研究与应用[D]. 刘晓光. 兰州交通大学, 2020(01)
- [7]DNA微阵列芯片法在耐药结核分枝杆菌检测中的准确性和应用价值[A]. 单永梅,王伟炳,王建美. 耐药结核病临床诊治难点与热点问题专题研讨会资料汇编, 2018
- [8]DNA-微阵列芯片法检验结核与非结核分枝杆菌的临床应用价值[J]. 徐微. 系统医学, 2018(15)
- [9]基于改进的svm的基因微阵列数据疾病预报[D]. 李小鹏. 浙江大学, 2018(03)
- [10]基于极限学习机（ELM）岭回归的DNA微阵列数据填补[J]. 张建军,张天成,隋宇婷,岳德君. 小型微型计算机系统, 2014(10)