一、1988年新疆巴楚地区出血热疫源地监测报告（论文文献综述）
王珊珊[1]（2019）在《海南鼠源性细小病毒、多瘤病毒及Gemycycrularvirus的基因组分析》文中指出研究目的:对海南省部分地区野生鼠类样本携带的致病性及潜在致病性病毒进行基因组分析,为防控以鼠源性新发致病性疾病的流行提供数据支撑。研究方法:本课题基于本实验前期对海南省部分地区野生鼠类样本病毒宏基因组高通量测序及生物信息学分析的结果,从中筛选出可能导致人类和动物致病鼠源性细小病毒（parvovirus,ParV）、多瘤病毒（polyomavirus,PyV）及Gemycircularvivus（GemyCV）的reads,分别对三种病毒通过PCR技术进行全基因组扩增、序列拼接、基因组遗传进化分析,初步建立了巢式PCR（Nested PCR）检测鼠源性ParV和PyV方法。研究结果:（1）海南鼠源性ParV的基因组分析基于前期对海南临高地区捕获的野生鼠咽拭子样本病毒宏基因组高通量测序及生物信息学的结果分析,发现了1603条reads与啮齿类动物ParV具有同源性（80%-94%）,疑似ParV（ParV/LG株）。应用PCR技术进行全基因组扩增、基因全长拼接等方法,获得ParV/LG株的全基因组序列。基因组全长为4691 bp,编码非结构蛋白（NS1）和衣壳蛋白1（VP1）,分别编码721 aa及583 aa。在NS1序列（448-GPASTGKS-455）中发现ATP或GTP结合的Walker环基序（GXXXXGK[T/S]）,NS1和VP1的GC含量分别为54.57%和45.43%。基于NS1和VP1氨基酸序列构建的进化树分析显示,Parv/LG株与Kilham rat virus株（KRV）（AF321230.1）亲缘关系最密切,同源性分别为91%和97%,该病毒基因组已上传至GenBank,序列号为MK530648.1,命名为parvovirus Ro/Lingo/China。初步建立了基于该病毒VP1基因的Nested PCR检测方法。（2）海南鼠源性PyV的基因组分析基于前期对海南海口地区捕获的野生褐家鼠咽拭子样本病毒宏基因组高通量测序及生物信息学的结果分析,发现了114条reads与啮齿类动物PyV具有同源性（93%-97%）,疑似PyV（PyV/HK株）。应用PCR技术进行全基因组扩增、基因全长拼接等方法,获得PyV/HK株的全基因组序列。基因组全长为5318 bp,编码早期基因和晚期基因,早期基因编码大T抗原（LTAg）、中间T抗原（MTAg）和小T抗原(（STAg）,晚期基因编码主要衣壳蛋白1（VP1）、衣壳蛋白2（VP2）和衣壳蛋白3（VP3）,LTAg,MTAg,STAg,VP1,VP2和VP3分别编码776 aa,414aa,194 aa,384 aa,347 aa和228 aa。基于LTAg氨基酸序列构建的进化树分析显示,PyV/HK株与Rattus norvegicus polyomavirus 1（RnorPyV1）株（KR075945.1）的亲缘关系最密切,LTAg,MTAg和VP1氨基酸的同源性分别为99%,99%和99%,该病毒基因组已上传至GenBank,序列号为MK372231.1,命名为polyomavirus sp RN/Haikou/China。初步建立了基于该病毒的VP1基因的Nested PCR检测方法。（3）海南鼠源性GemyCV的基因组分析基于前期对海南海口褐家鼠咽拭子样本病毒宏基因组高通量测序及生物信息学分析的结果,发现了298条reads与GemyCV具有同源性（81%-97%）,疑似GemyCV（GemyCV/HK株）。应用PCR技术进行全基因组扩增、基因全长拼接等方法,获得GemyCV/HK株的全基因序列。基因组全长为2199 bp,编码衣壳蛋白（Cap）、主要复制蛋白（Rep 1）和次要复制蛋白（Rep 2）,分别编码322aa、194aa和112aa。GemyCV/HK株基因间区域（Iterons）（127-nt）含有一个具有九聚体[TAAAATTTA]的非典型茎环结构,Rep 1和Rep 2之间具有独特的内含子（Intron）。基于Cap和Rep氨基酸序列构建的进化树分析显示,GemyCV/HK株与gemycircularvirus SL1（GemyCV-SL1）株（KP133075.1）亲缘关系最密切,氨基酸的同源性分别是97%和99%,该病毒基因组已上传至GenBank,序列号为MK293717.1,命名为gemycircularvirus RN/Haikou/China。结论:（1）获得了ParV/LG株的全基因序列,遗传进化分析表明,ParV/LG株与可引起大鼠致病的KRV株亲缘关系最密切,表明海南临高地区鼠类携带ParV。初步建立了基于ParV/LG株VP1基因的Nested PCR检测方法。（2）获得了PyV/HK株的全基因序列,遗传进化分析表明,PyV/HK株与RnorPyV1株的亲缘关系最密切,表明海南海口地区鼠类携带PyV。初步建立了基于PyV/HK株VP1基因的Nested PCR检测方法。（3）获得了GemyCV/HK株的全基因序列,遗传进化分析表明,GemyCV/HK株与GemyCV-SL1株的亲缘关系最密切,表明海南海口地区鼠类携带GemyCV。
寇春[2]（2016）在《新疆准噶尔盆地周边地区蜱与鼠类携带虫媒病毒的调查研究》文中研究指明新疆维吾尔自治区位于我国西北边陲,亚欧大陆腹地,与俄罗斯、蒙古、巴基斯坦等8家接壤,陆上对外口岸较多,与周边国家经济交往频繁。新疆地理生态环境多样,物种分布广与内地有着明显的不同,适合蜱的生长繁殖,其分布广泛,种类较多,可传播多种虫媒病毒。新疆地区时有人、畜不明原因发热和脑炎散发或流行,疑似虫媒病毒引起,但是由于种种原因,目前还没有进行过系统而深入的调查,急需加强研究。我国已知流行的4种虫媒病毒病中新疆出血热和蜱传脑炎在新疆都有发现,在新疆既往进行的虫媒病毒调查中,已经从新疆地区的全沟硬蜱、森林革蜱、亚洲璃眼蜱、边缘革蜱和草原革蜱中分别分离到蜱传脑炎病毒,东方马脑炎病毒,新疆出血热病毒、新环状病毒。从按蚊、库蚊、伊蚊中分别分离到辛德毕斯病毒,西方马脑炎病毒,辽宁病毒,Tahyna病毒等。但尚缺乏对新疆准噶尔盆地周边地区虫媒病毒的深入调查研究。为了解新疆准噶尔盆地周边地区蜱及啮齿动物（鼠）携带虫媒病毒情况,应用RT-PCR、细胞培养及生物信息学等方法对该地区蜱及啮齿动物（鼠）感染虫媒病毒情况进行了调查研究。本项研究结果对丰富新疆乃至国内虫媒病毒资源和进行新疆地区虫媒病毒病预防控制具有重要意义。主要内容包括以下方面:1.新疆啮齿动物（鼠）样本采集及携带虫媒病毒的初步检测2014-2015年在新疆准噶尔盆地周边地区乌苏、阜康、奇台、吉木萨尔和石河子149团等地区采集了1054只啮齿动物,其中2014年,2015年分别为684只和370只,主要种类有长尾黄鼠（Spermophilus undulatus）、子午沙鼠（Meriones meridianus Pallas）、大沙鼠（Rhombomys opimus）和三趾跳鼠（Dipus sagitta）。2014年鼠样本根据采集地、属种与脏器的不同分成193组。通过RT-PCR的方法对鼠中发热伴血小板减少综合征病毒（SFTSV）、新疆出血热病毒（XHFV）、荆门病毒（JMTV）以及古尔图病毒（Guertu virus）的感染情况进行了检测。结果发现总样本中Guertu virus的S片段阳性率为9.3%,SFTSV的S片段阳性率为6.2%。Guertu virus与SFTSV主要集中在乌苏地区,主要宿主为长尾黄鼠。提示长尾黄鼠为Guertu virus与SFTSV新的宿主。2015年样本同样方法分组成136组,除检测以上4种病毒外还检测了汉坦病毒（HTV）,蜱传脑炎病毒（TBEV）与黄病毒属病毒（Flavivirus）。结果显示总样本中XHFV的阳性率为11%,SFTSV阳性率为7.4%,Guertu virus阳性率为21.3%。阳性样本主要集中在乌苏地区。根据2014-2015年对准噶尔盆地周边地区鼠样本的检测结果,提示新疆乌苏地区可能存在XHFV、SFTSV与Guertu virus的自然疫源地。2.新疆蜱中新病毒的发现、分离及在蜱中分子流行病学调查2014年在新疆乌苏地区共采集了13662只草原革蜱（Dermacentor nuttalli）。根据采集地与蜱种类不同按每组约200只左右分成68组,选取8组有代表样性的样本,经武汉中科院病毒研究所的454高通量测序,有7组样本中存在黄病毒科病毒的重叠群（Contig）。对获得的Contig利用NCBI中的BLISA工具搜索,发现所有Contig都与荆门蜱病毒（Jingmen tick virus,JMTV）的核酸序列相似性最高,在65%-84%之间。暂将该新病毒命名为新疆蜱病毒（Xinjiang tick virus,XJTV）。选取454高通量测序的3组阳性样本,利用Vero细胞对XJTV进行病毒培养和分离,细胞传至第7代后,仅在第一代培养细胞的上清中检测到有XJTV的核酸片段,同时对第一代细胞的上清及细胞制备切片进行电镜观察,发现在细胞与上清中存在90nm左右的病毒粒子。通过RT-PCR对XJTV在乌苏地区蜱中的流行情况进行检测。结果表明,2014年乌苏地区的68组草原革蜱中,检测到XJTV阳性组数54组,其阳性率达79.4%。说明草原革蜱为XJTV的媒介之一,该病毒可能在乌苏地区的蜱中广泛分布。3.新疆蜱携带XJTV基因组序列信息分析与克隆454高通量测序的Contig与JMTV基因序列比对后发现只有部分S1与S3的信息,利用获得的基因序列设计引物进行RT-PCR得到了该病毒的S1与S3全序列信息。对采自新疆羊沟地区的一份阳性样本经RNA-Seq技术（上海伯豪公司）分析获得了S2与S4的部分序列信息,通过设计特异性引物用RT-PCR的方法获得了该病毒的S2与S4全序列信息。利用RT-PCR和重叠RT-PCR的方法分别将结构蛋白S1,S2,S3与S4全基因序列克隆到p GEM-Teasy载体中,这为更好地保存病毒的基因组信息,以及对该病毒分子特性和相关基因功能等性质的研究提供了基础。4.XJTV非结构蛋白和结构蛋白的生物信息学分析利用相关生物学软件Signa IP 4.1、TMHMM、Net NGlyc1.0 Serve、Phrye、MEGA5与DNAStar等对XJTV编码的非结构蛋白（NSP1与NSP2）和结构蛋白（VP1、VP2和VP3）进行了分析。在二级结构中XJTV与黄病毒科的代表株在非结构蛋白的功能区域的motif保守性较高。利用已经解析蛋白晶体结构的登革热病毒（DENV-4）和日本脑炎病毒（JEV）作为模板模拟出XJTV的S1与S3编码蛋白的三维结构。结果发现XJTV基于二级结构保守的motif在空间位置上也与模板蛋白的motif一一对应,提示这些保守结构在病毒的生命周期中可能行使着相同的生物学功能。对结构蛋白VP1、VP2与VP3的跨膜区域、信号肽与糖基化位点进行分析预测,结果表明结构蛋白VP1、VP2与VP3分别具有病毒的包膜蛋白、衣壳蛋白和膜蛋白的功能。基于XJTV的S1与S3编码的非结构蛋白构建的系统发育进化树分析结果显示,与选择的黄病毒科的部分代表毒株相比,XJTV不属于黄病毒科已有的三个属,而与JMTV和MGTV位于进化树单独的分支中。提示XJTV可能是黄病毒科一个新的属中的毒株。5.XJTV衣壳蛋白重组表达质粒的构建及其兔多克隆抗体的制备将XJTV与JMTV编码结构蛋白的基因序列进行比较后,选取相对保守的衣壳蛋白（Capsid protein）ORF片段序列,将其构建到原核表达载体p ET28a与p ET32a中,同时构建至真核表达载体pc DNA3.1中,通过序列测定,结果表明成功获得了三种表达质粒p ET28a-CP,p ET32a-CP和pc DNA3.1-CP。将p ET28a-CP质粒转染大肠杆菌中表达纯化获得重组蛋白,用纯化的重组蛋白免疫新西兰白兔制备抗体,经检测所获得的抗体效价达1:100000以上,通过western blot检测证实了该抗体与抗原有很好的结合亲和性。构建的原核表达质粒及制备的抗体可为后续开展病毒血清学检测及XJTV的免疫学特性研究工作提供了条件。将构建的真核表达载体p CDNA3.1-CP转染入293T细胞,经IFA检测,表明VP2基因编码的衣壳蛋白在该细胞中成功表达,这为后续病毒的包装以及对哺乳动物的侵染机制研究提供了基础。
张璘[3]（2014）在《新疆北疆地区蜱种分布及蜱源性病原检测方法的建立》文中认为目的：蜱媒疾病是指由蜱传播的某些种类的病毒、细菌和寄生虫等所引起的一系列疾病，在世界范围内广泛流行。在中国新疆蜱媒疾病是非常普遍的，但近年来对于蜱种的分布及携带相应病原的基因型等方面的信息较少，并且没有一种相对简便的检测方法。本研究通过对新疆北疆部分地区蜱的地理分布和相应病原体的携带，为研究媒介蜱和蜱媒病原体的遗传多态性和进化关系奠定基础。方法：⑴于新疆北疆14个县市19个调查点采集畜牧体表寄生硬蜱，通过传统形态学分析，结合线粒体16S rDNA基因与COI基因进行综合分析，鉴定所采集的蜱种的种属及其分布特征。⑵采用病原体分离培养和巢式PCR扩增测序技术对上述鉴别获得的所有蜱种进行蜱媒病原体的分离检测，确定病原体基因型，调查蜱媒病原体的携带率。结果：经传统形态学及分子生物学分析，采集获得4711只寄生蜱可归属为2个亚科，4个属，7个种，分别为亚洲璃眼蜱，刻点血蜱，草原革蜱，边缘革蜱，图兰扇头蜱，残缘璃眼蜱和嗜群血蜱。相比于三十年前，随着气温及降水的改变，前五位蜱种成为该区域的优势蜱种。并于部分采集点发现一些新兴蜱种。蜱媒莱姆疏螺旋体于克拉玛依、木垒、裕民、伊宁、察布查尔和石河子-沙湾地区检出，阳性比例分别为18%、6.25%、3.33%、53.5%、86%和6.1%，且从新疆刻点血蜱、亚洲璃眼蜱、图兰扇头蜱和边缘革蜱中分离到莱姆病螺旋体。通过对莱姆疏螺旋体5S-23S rRNA基因间隔区测序分析表明，获得3种伯氏疏螺旋体不同序列，同源性98.6%-99.5%；4种伽式疏螺旋体不同序列，同源性在98.8%-99.6%，并从图兰扇头蜱中首次分离到伯氏疏螺旋体。另外，采用巢式PCR扩增结果可知新疆北疆不同地区、不同蜱种携带埃立克次体、人粒细胞无形体，且携带率较高，提示新疆北疆地区存在两种蜱媒立克次体病的自然疫源地。结论：（1）采集获得的成年蜱4711只，鉴定为2个亚科，4个属，7个种，亚洲璃眼蜱、刻点血蜱成为新疆北疆14个县市的新优势蜱种；（2）首次从新疆北疆地区分离到伯氏疏螺旋体，并证明其分布及携带蜱种发生了扩散；（3）从调查点采集到的蜱种均检测出蜱媒立克次体病，证明新疆北疆可能存在立克次体自然疫源地；（4）优势蜱种的改变、病原分布的扩散和检测的高阳性率，提示随着气候及降雨量等因素的改变，蜱媒疾病的分布及病原类型也发生变化。
冯崇慧,刘雄飞,王冬莉,白旭华,张晓兵,刘全民,刘宏斌,顾媛,章建民[4]（2004）在《1988年新疆巴楚地区出血热疫源地监测报告》文中指出1988年45月对新疆巴楚县和农三师部分地区和团场中新疆出血热疫源地继续进行监测。以农三师50团为基地,东起夏河西至阿克沙克马拉勒（农三师48团）,长约110km,北靠乌-喀公路,南抵叶尔羌河,宽约40km范围内共调查了17个点,主要以未开垦的荒漠牧场景观为主。监测内容包括对可疑病人、牧工和兽医以及部分健康人群的血清抗体检查、病原分离和治疗血清使用疗效观察;对48,50和53团不同连队共10个羊群血清抗体水平的调查和对部分绵羊血液进行病毒的分离;荒漠胡杨林中游离成蜱的病毒分离等项目。结果在4月底至5月下旬在50团发现3例新疆出血热病人,均经病毒分离确诊,其中2例因误诊耽误了抢救的机会而死亡;另外在查访53团和巴楚县医院时各发现1例病人,经血清学确诊。391份羊血清用ELISA抑制法检测抗体的阳性率为13.8%77.4%;McAb-RPHI阳性率为13.8%70.9%。从3例病人、羊血10份和9批亚洲璃眼蜱（每批50只）中分离到9株新疆出血热病毒。并用McAb致敏血球RPHA法检测血液中病毒抗原,达到了早期快速地确诊病人。通过1988年现场监测工作,进一步证实了1984年调查结果,巴楚地区的新疆出血热的疫源地活动性仍很强。人群和家畜抗体水平及亚洲璃眼蜱的带毒率20多年来基本没有变化,今年在这一局部地区发现5例病人,死亡2例,表明本病对当地人民健康和生命的威协仍然是一个现实问题。
二、1988年新疆巴楚地区出血热疫源地监测报告（论文开题报告）
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、1988年新疆巴楚地区出血热疫源地监测报告（论文提纲范文）
（1）海南鼠源性细小病毒、多瘤病毒及Gemycycrularvirus的基因组分析（论文提纲范文）
| 缩略语 |
| 中文摘要 |
| Abstract |
| 前言 |
| 第一章 海南鼠源性细小病毒的基因组分析 |
| 1.1 材料与方法 |
| 1.1.1 试剂和仪器 |
| 1.1.2 方法 |
| 1.1.2.1 引物设计与合成 |
| 1.1.2.2 病毒核酸的提取 |
| 1.1.2.3 细小病毒PCR验证 |
| 1.1.2.4 细小病毒全基因组扩增 |
| 1.1.2.5 PCR产物目的条带的胶回收 |
| 1.1.2.6 回收产物的连接 |
| 1.1.2.7 连接产物转化感受态细菌及培养 |
| 1.1.2.8 病毒基因组注释与进化分析 |
| 1.1.2.9 细小病毒NestedPCR检测扩增技术初步建立 |
| 1.2 结果 |
| 1.2.1 细小病毒基因组全长扩增 |
| 1.2.2 细小病毒基因组序列比较结果 |
| 1.2.2.1 基因组结构分析 |
| 1.2.2.2 细小病毒同源性分析 |
| 1.2.2.3 细小病毒进化树分析 |
| 1.2.3 细小病毒NestedPCR检测扩增技术初步建立 |
| 1.2.3.1 NestedPCR的扩增 |
| 1.2.3.2 NestedPCR产物序列分析 |
| 1.3 讨论 |
| 1.4 小结 |
| 第二章 海南鼠源性多瘤病毒的基因组分析 |
| 1.1 材料与方法 |
| 1.1.1 试剂和仪器 |
| 1.1.2 方法 |
| 1.1.2.1 引物设计与合成 |
| 1.1.2.2 病毒核酸的提取 |
| 1.1.2.3 多瘤病毒PCR验证 |
| 1.1.2.4 多瘤病毒全基因组扩增 |
| 1.1.2.5 PCR产物目的条带的胶回收 |
| 1.1.2.6 回收产物的连接 |
| 1.1.2.7 连接产物转化感受态细菌及培养 |
| 1.1.2.8 病毒基因组注释与进化分析 |
| 1.1.2.9 多瘤病毒Nested PCR检测扩增技术初步建立 |
| 1.2 结果 |
| 1.2.1 多瘤病毒基因组全长扩增 |
| 1.2.2 多瘤病毒基因组序列比较结果 |
| 1.2.2.1 基因组结构分析 |
| 1.2.2.2 多瘤病毒同源性分析 |
| 1.2.2.3 多瘤病毒进化树分析 |
| 1.2.3 多瘤病毒NestedPCR检测扩增技术初步建立 |
| 1.2.3.1 NestedPCR的扩增 |
| 1.2.3.2 Nsted PCR产物序列分析 |
| 1.3 讨论 |
| 1.4 小结 |
| 第三章 海南鼠源性Gemycirularvirus的基因组分析 |
| 1.1 材料与方法 |
| 1.1.1 试剂和仪器 |
| 1.1.2 方法 |
| 1.1.2.1 引物设计与合成 |
| 1.1.2.2 病毒核酸的提取 |
| 1.1.2.3 Gemycirularvirus PCR验证 |
| 1.1.2.4 Gemycirularvirus全基因组扩增 |
| 1.1.2.5 PCR产物目的条带的胶回收 |
| 1.1.2.6 回收产物的连接 |
| 1.1.2.7 连接产物转化感受态细菌及培养 |
| 1.1.2.8 病毒基因组注释与进化分析 |
| 1.2 结果 |
| 1.2.1 Gemycirularvirus基因组全长扩增 |
| 1.2.2 Gemycycrularvirus基因组序列比较结果 |
| 1.2.2.1 基因组结构分析 |
| 1.2.2.2 Gemycircularvirus同源性分析 |
| 1.2.2.3 Gemycircularvirus进化树分析 |
| 1.3 讨论 |
| 1.4 小结 |
| 参考文献 |
| 综述 鼠类携带主要病毒性病原的研究进展 |
| 综述参考文献 |
| 个人简历 |
| 致谢 |
（2）新疆准噶尔盆地周边地区蜱与鼠类携带虫媒病毒的调查研究（论文提纲范文）
| 摘要 |
| Abstract |
| 第一章 文献综述 |
| 1 新疆地区虫媒病毒调查研究状况 |
| 1.1 新疆主要虫媒病毒 |
| 1.2 新疆虫媒病毒研究的发展与展望 |
| 2 黄病毒研究进展 |
| 2.1 基因组及复制周期 |
| 2.2 黄病毒的检测方法 |
| 2.3 黄病毒属主要诊断抗原的研究进展 |
| 2.4 黄病毒的流行情况 |
| 3 研究的目的及意义 |
| 参考文献 |
| 第二章 新疆地区啮齿动物（鼠）携带虫媒病毒的分子生物学初步检测及分离 |
| 前言 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.2 方法 |
| 1.2.1 采集时间与采集地点 |
| 1.2.2 采集方法 |
| 1.2.3 样品研磨 |
| 1.2.4 RNA的提取 |
| 1.2.5 cDNA的制备 |
| 1.2.6 引物设计与合成 |
| 1.2.7 PCR |
| 1.2.8 病毒的分离与检测 |
| 2 结果 |
| 3 讨论 |
| 参考文献 |
| 第三章 新疆蜱中新病毒的发现、分离及蜱中分子流行病学调查 |
| 前言 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.2 方法 |
| 1.2.1 采集时间与采集地点 |
| 1.2.3 样本研磨 |
| 1.2.4 RNA的提取 |
| 1.2.5 cDNA的合成 |
| 1.2.6 454高通量测序检测样本的准备 |
| 1.2.7 PCR检测 |
| 1.2.8 组织细胞培养法分离病毒 |
| 1.2.9 电镜观察 |
| 2 结果 |
| 2.1 捕蜱数量及种类 |
| 2.2 454高通测序结果 |
| 2.3 蜱样本分毒结果 |
| 2.4 电镜观察实验 |
| 2.5 蜱样本中XJTV的流行病学调查 |
| 3 讨论 |
| 参考文献 |
| 第四章 新疆蜱携带XJTV基因组序列信息分析与克隆 |
| 前言 |
| 1 材料及方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.2 实验方法 |
| 1.2.1 454高通量测序序列分析与拼接 |
| 1.2.2 RNA-seq高通测序序列分析与拼接 |
| 1.2.3 XJTV序列的 5'与 3'两端序列信息的获取 |
| 1.2.4 XJTV每节段中的片段克隆到pGEM-Teasy |
| 1.2.5 XJTV每节段全长克隆至pGEM-Teasy载体中 |
| 1.2.6 序列的拼接及分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 454高通量测序结果分析 |
| 2.2 RNA-seq高通量测序结果分析 |
| 2.3 XJTV全序列信息的克隆 |
| 3 讨论 |
| 参考文献 |
| 第五章 XJTV序列的生物信息学分析 |
| 前言 |
| 1 方法 |
| 1.1 基因序列选取 |
| 1.2 二级结构预测 |
| 1.3 三级结构预测 |
| 1.4 系统发育进化分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 XJTV二级结构分析结果 |
| 2.1.1 糖基化位点分析 |
| 2.1.2 信号肽分析 |
| 2.1.3 跨膜区域 |
| 2.1.4 黄病毒科保守的模体分析 |
| 2.2 非结构蛋白三级结构预测 |
| 2.3 NS3与NS5的进化分析 |
| 3 讨论 |
| 参考文献 |
| 第六章 XJTV的CP蛋白基因原核与真核载体构建及抗体制备 |
| 前言 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.2 方法 |
| 1.2.1 CP蛋白基因引物的设计、合成与PCR反应 |
| 1.2.2 重组表达载体的构建 |
| 1.2.3 CP蛋白的原核表达 |
| 1.2.4 真核质粒转染实验 |
| 1.2.5 重组CP蛋白的大量诱导及纯化 |
| 1.2.6 重组CP蛋白兔多克隆抗体的制备 |
| 1.2.7 Western Blotting分析 |
| 2 结果与分析 |
| 2.1 CP蛋白基因原核与真核质粒构建结果 |
| 2.2 重组CP蛋白基因原核表达结果 |
| 2.3 重组CP基因在真核细胞中表达结果 |
| 2.4 Western Blotting检测抗重组CP蛋白的兔多克隆抗体 |
| 3 讨论 |
| 参考文献 |
| 结论与展望 |
| 致谢 |
| 个人简历 |
（3）新疆北疆地区蜱种分布及蜱源性病原检测方法的建立（论文提纲范文）
| 课题来源 |
| 摘要 |
| Abstract |
| 主要符号表 |
| 引言 |
| 第一章 |
| 摘要 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.2 方法 |
| 2 结果 |
| 2.1 形态学鉴定 |
| 2.2 各类蜱的形态特点 |
| 2.3 16S rDNA 基因和 COⅠ基因的扩增结果 |
| 2.4 16S rDNA和 COⅠ质粒PCR鉴定结果 |
| 2.5 蜱线粒体 16S rDNA 基因和 COⅠ基因的测序及分型 |
| 2.6 蜱的分布变化 |
| 3 讨论 |
| 3.1 蜱的分布与研究 |
| 3.2 分子生物学研究的展望与存在的问题 |
| 参考文献 |
| 第二章 |
| 摘要 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.2 方法 |
| 2 结果 |
| 2.1 形态学鉴定 |
| 2.2 分子生物学研究 |
| 3 讨论 |
| 参考文献 |
| 第三章 |
| 摘要 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.2 方法 |
| 2 结果 |
| 2.1 硝酸银染色 |
| 2.2 5S-23S rRNA 基因和 OspC 基因的扩增结果 |
| 2.3 莱姆疏螺旋体的病原体检测阳性率 |
| 2.4 莱姆疏螺旋体测序及分型 |
| 3 讨论 |
| 参考文献 |
| 第四章 |
| 摘要 |
| 1 材料与方法 |
| 1.1 材料 |
| 1.2 方法 |
| 2 结果 |
| 2.1 人粒细胞无形体及查菲埃立克体 16S rRNA 基因的扩增结果 |
| 2.2 立克次体的分子学检测结果 |
| 2.3 立克次体病原体测序及分型 |
| 3 讨论 |
| 参考文献 |
| 结论 |
| 创新点 |
| 文献综述 |
| 1 蜱的基本特性 |
| 1.1 种属 |
| 1.2 形态特征 |
| 1.3 生活史 |
| 1.4 寿命 |
| 1.5 生态 |
| 2 蜱的系统分类学研究进展 |
| 2.1 传统研究方法 |
| 2.2 现代研究方法 |
| 3 新疆蜱的分布 |
| 4 主要蜱媒疾病 |
| 4.1 莱姆病 |
| 4.2 蜱媒立克次体病 |
| 4.3 Q 热 |
| 4.4 土拉弗氏菌病 |
| 4.5 森林脑炎 |
| 4.6 新疆出血热 |
| 4.7 发热性血小板减少综合征 |
| 4.8 原虫病 |
| 5 新疆蜱媒病研究 |
| 5.1 莱姆病 |
| 5.2 蜱媒立克次体病 |
| 5.3 森林脑炎 |
| 5.4 新疆出血热 |
| 6 问题与展望 |
| 参考文献 |
| 附表 14 个调查县市地理信息 |
| 致谢 |
| 作者简介及在学期间研究项目、发表文章 |
| 导师评阅表 |
（4）1988年新疆巴楚地区出血热疫源地监测报告（论文提纲范文）
| 1 材料与方法 |
| 1.1 监测方法: |
| 1.1.1 病例监测: |
| 1.1.2 人群血清学调查: |
| 1.1.3 家畜血清学调查: |
| 1.1.4 野生动物抗体调查: |
| 1.1.5 硬蜱和家畜带毒率调查: |
| 1.2 实验室方法: |
| 1.2.1 病毒分离: |
| 1.2.2 反向被动血凝和血凝抑制试验: |
| 1.2.3 ELISA双抗体夹心抑制试验和间接混合夹心法: |
| 1.2.4 IgM-ELISA捕捉法检测早期IgM抗体[5]: |
| 2 结果 |
| 2.1 病例报告: |
| 2.2 人群血清抗体水平调查: |
| 2.3 家畜血清抗体水平调查: |
| 2.4 病原的分离: |
| 3 讨论 |
四、1988年新疆巴楚地区出血热疫源地监测报告（论文参考文献）
- [1]海南鼠源性细小病毒、多瘤病毒及Gemycycrularvirus的基因组分析[D]. 王珊珊. 海南医学院, 2019(02)
- [2]新疆准噶尔盆地周边地区蜱与鼠类携带虫媒病毒的调查研究[D]. 寇春. 新疆大学, 2016(06)
- [3]新疆北疆地区蜱种分布及蜱源性病原检测方法的建立[D]. 张璘. 石河子大学, 2014(03)
- [4]1988年新疆巴楚地区出血热疫源地监测报告[J]. 冯崇慧,刘雄飞,王冬莉,白旭华,张晓兵,刘全民,刘宏斌,顾媛,章建民. 地方病通报, 2004(S1)