一、优质细毛羊遗传多样性的微卫星分析(论文文献综述)
肖帆,张利平,朗侠,吴建平,张筱艳,靳继鹏[1](2021)在《不同品种绵羊D-loop区遗传多样性研究》文中指出线粒体DNA(Mitochondria DNA,mtDNA)D-loop区的进化速度快且多态性丰富,因此在生物的遗传多样性和起源进化研究中具有重要意义。采用PCR扩增和基因测序的方法分析甘肃高山细毛羊(G)、欧拉羊(O)、杜泊羊(D)、蒙古羊(M)、小尾寒羊(S)和湖羊(H)的线粒体DNA D-loop区遗传多样性和进化关系。结果显示,试验羊D-loop区中GC含量低于AT含量,共检测到171个变异位点,单一多态位点58个,简约信息位点113个,共87个单倍型,单倍型多样度(Hd)分别为0.993、1.000、0.968、1.000、0.933和1.000,核苷酸多样度(Pi)分别为0.022 37、0.014 63、0.011 93、0.017 47、0.021 40和0.023 48,湖羊的平均核苷酸差异度最大(K=31.622),而杜泊羊最小(K=15.995)。蒙古羊和杜泊羊的核苷酸平均差异数Kxy最大,蒙古羊和欧拉羊的核苷酸平均差异数Kxy最小。核苷酸歧异度Dxy与核苷酸平均差异数Kxy结果一致。系统发育树结果显示,湖羊与小尾寒羊先聚集在一起,然后与杜泊羊聚为一类;欧拉羊与蒙古羊先聚为一类,然后与甘肃高山细毛羊聚为一大类,说明湖羊与小尾寒羊遗传差异小。
李标[2](2019)在《利用微卫星分析盐池滩羊核心群体母羊的遗传多样性》文中指出本研究随机遴选96只宁夏盐池滩羊核心群体母羊,利用基于文献和实验筛选的32个微卫星标记,进行了毛细管电泳检测,分析了盐池滩羊核心群体母羊的遗传多样性,并将微卫星位点与体尺数据进行了关联。结果如下:1.共有26个微卫星标记呈高度多态性,微卫星标记DU264615、HUJ625和BM2504呈中度多态性,微卫星标记URB024、BMS1678、CP16由于没有多态性或等位基因数不足4个,予以剔除。故使用29个微卫星标记检测该核心群体,平均等位基因数为9.5000,平均有效等位基因数4.4100,平均多态信息含量0.6918,平均期望杂合度0.7224,平均观测杂合度 0.6434。2.微卫星位点MAF33与体高、胸深存在显着关联(P<0.05);BMS1788与荐高显着关联(P<0.05),与胸围极显着关联(P<0.01);管围与5个微卫星位点MAF33、BMS500、BL41、BMS835和BOVILS56均极显着关联(P<0.01)。MAF33的基因型151/155对个体的体高和胸深有负效应(P<0.05);BMS1788的基因型184/188对个体的荐高有正效应(P<0.05),基因型178/194可能对个体的胸围有负效应(P<0.05);BMS835的基因型115/133和标记BOVILS56的基因型221/230都对个体的管围有正效应(P<0.05)。3.与以往记录和品种志数据相比,通过数年的草场禁牧和本品种选育,该群体滩羊母羊的成年体重有显着增加。综上,所检测的宁夏盐池滩羊核心群体母羊的遗传多样性丰富,但未出现明显的遗传分化和新的基因群,可供群体内选择的范围较广。长期保种选育加环境改善的实践也表明,对该滩羊群体实施品种内提纯复壮的遗传改良前景良好。6个与体尺性状关联的微卫星位点对滩羊的分子辅助育种将提供帮助和参考。
王婷,吴登俊[3](2018)在《微卫星分子标记分析四川绵羊群体遗传多样性》文中认为为探究四川省6个绵羊群体的遗传多样性,实验应用12个微卫星标记计算基因频率、有效等位基因数、杂合度及多态信息含量来评估群体内遗传多样度,通过遗传距离聚类图、群体结构推测图、主成分分析及群体间分子方差分析来评估群体间遗传关系。结果表明:6个绵羊群体在12个微卫星位点的平均有效等位基因数为3.0063.176,平均多态信息含量变化为0.5590.612,平均期望遗传杂合度为0.6100.670;6个绵羊群体间的遗传关系与地理分布情况及育成史实不完全一致,但遗传距离聚类图、群体结构推测图和主成分分析结果均显示,6个绵羊群体中布拖黑绵羊类群与贾洛绵羊类群遗传关系更近;6个绵羊群体间方差组分F统计量结果为0.112 39,处于中度分化水平。
张正义,邢秀梅,胡鹏飞,刘松啸,董依萌,鞠贵春[4](2017)在《微卫星标记在动物遗传多样性分析的研究进展》文中研究表明文中对微卫星标记对猪、马、牛、羊、鹿等动物进行多态性扩增,分析出各物种间遗传多样性水平的丰富程度进行了综述,并对应用该技术进行有效的人工保护育种,保护濒危群体,丰富物种遗传多样性,维护生态系统稳定进行了讨论。
杨敏[5](2014)在《中国细毛羊群体遗传多样性分析》文中提出为了从分子水平调查中国细毛羊的遗传资源现状,掌握中国细毛羊的遗传结构及选育潜力,从而为制定科学有效的保种策略和品种培育规划提供理论依据。本实验以ABI3730XL全自动基因序列分析仪为平台,应用联合国粮农组织和国际动物遗传学会推荐的10对微卫星引物并结合荧光PCR技术,以中国美利奴羊(新疆型)、中国美利奴羊超细品系、新吉细毛羊、敖汉细毛羊、甘肃高山细毛羊、甘肃高山细毛羊超细型品系和青海细毛羊为研究对象,湖羊和凉山半细毛羊作为参照对象,对其进行了遗传多样性检测及分析,研究结果如下:1.10个微卫星位点之间是连锁不平衡的,且在9个绵羊群体中均表现为高度多态,可作为绵羊遗传多样性和群体间遗传关系分析的有效标记。2.7个细毛羊群体的平均多态信息含量为0.6938,杂合度均值为0.7353,平均等位基因丰富度为7.4343,表明被研究群体的遗传多样性较为丰富;哈代-温伯格平衡定律检验结果表明甘肃高山细毛羊超细型品系与中国美利奴超细型品系偏离平衡的位点数较多,分别为7个和5个。说明应适当加强群体的本品种选育或横交选育。3.采用非加权配对算术平均法构建的聚类图和采用主成分分析法得到的散点图均显示,细毛羊群体与湖羊和凉山半细毛羊为不同的2类;甘肃高山细毛羊和青海细毛羊的遗传距离较近;中国美利奴羊(新疆型)、中国美利奴羊超细品系、新吉细毛羊、甘肃高山细毛羊超细品系和敖汉细毛羊的遗传距离较近。说明群体的遗传结构比较清楚。4.遗传分化分析发现,7个细毛羊群体间的遗传分化系数(Fst)较低,均小于0.05,7个群体间存在较大的基因流,新吉细毛羊与中国美利奴羊(新疆型)之间的基因流为最大31.30,青海细毛羊与敖汉细毛羊群体间基因交流8.02,为最小,较大的基因流可能是导致各群体间遗传分化程度低的一个主要原因;各个群体内近交系数均为负值,表明群体内出现杂合子过剩的情况。说明实施联合育种与定向选育的作用明显。
郭婷婷,杨博辉,郭健,牛春娥,岳耀敬,孙晓萍,冯瑞林,刘建斌[6](2013)在《甘肃高山细毛羊超细毛型品系微卫星BMS1714和INRA61的遗传多样性分析》文中提出为了解甘肃高山细毛羊的遗传多样性,为地方绵羊品种的选种、选育及保种工作奠定基础,选取位于绵羊第25号染色体上的微卫星标记BMS1714和INRA61,对其进行遗传多样性研究。结果表明:BMS1714基因座有10个等位基因,PCR扩增片段大小在121~138 bp之间;优势等位基因为138,优势基因型为138/138;多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、平均杂合度(He)分别为0.714、4.029和0.731。INRA61基因座有11个等位基因,PCR扩增片段大小在279~292 bp之间;优势等位基因为286,优势基因型为286/286;PIC、Ne、He分别为0.776、5.127和0.809。因此,甘肃高山细毛羊超细毛品系微卫星位点BMS1714和INR A61均呈现高度多态,这两个位点可用于甘肃高山细毛羊的遗传多样性分析。
李洁,罗玉柱,李少斌,刘秀,成述儒[7](2013)在《甘肃高山细毛羊微卫星遗传多样性及亲子鉴定研究》文中进行了进一步梳理利用多重PCR和DNA测序技术对116只甘肃高山细毛羊(Ovis aries)13个微卫星座位的多态性进行检测,并结合父母本记录,开展亲子鉴定研究,以期为绵羊种质资源评价和亲子鉴定研究提供合理有效的微卫星座位。结果表明,甘肃高山细毛羊13个微卫星座位共检测到111个等位基因,在DRB1-INTRO2座位检测到的等位基因数最多(14个),SRCRCP5座位最少(5个)。ILSTS011座位观察杂合度最高(0.888),MAF214座位最低(0.500),除MAF214座位为中度多态外,其余12个座位均为高度多态,13个微卫星座位平均观察杂合度(Ho)为0.743,期望杂合度(He)为0.727,平均多态信息含量(PIC)为0.689。表明甘肃高山细毛羊遗传多样性较丰富。通过Cervus2.0计算,13个微卫星座位累计父权排除概率(CPE)达到了0.99994,11个具有高度多态的座位(除MAF214和OARJMP29外)CPE达到0.99985,12个座位达到0.99991,其中MAF214座位(中度多态)对CPE的影响较小,DRB1-INTRO2座位(高度多态)对CPE的影响较大,对亲子鉴定的贡献较大。本研究所分析的13个微卫星座位能够有效的提高亲子鉴定要求的精确度,可使实验操作更简便,成本降低,更适用于生产实际。
郭婷婷,杨博辉,郭健,牛春娥,岳耀敬,孙晓萍,冯瑞林,刘建斌[8](2012)在《微卫星标记BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊中的遗传多样性研究》文中认为为了研究甘肃高山细毛羊的遗传多样性,为地方山羊品种的选种、选育及保种工作奠定基础。本研究选取位于绵羊第25号染色体上的微卫星标记BMS1714和INRA61,对其进行遗传多样性研究。结果表明:微卫星标记BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊上呈现多态性。BMS1714基因座有10个等位基因,其片段大小在121~138bp之间;BMS1714基因座多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、平均杂合度(He)分别为0.714,4.029,0.731。INRA61基因座有11个等位基因,其片段大小在279~292bp之间;INRA61基因座的PIC、Ne、He分别为0.776,5.127,0.809。由此表明,微卫星位点BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊上均为高度多态位点,可用于甘肃高山细毛羊的遗传多样性分析。
郭婷婷,杨博辉,郭健,牛春娥,岳耀敬,孙晓萍,冯瑞林,刘建斌[9](2012)在《微卫星标记BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊中的遗传多样性研究》文中研究说明为了研究甘肃高山细毛羊的遗传多样性,为地方山羊品种的选种、选育及保种工作奠定基础。本研究选取位于绵羊第25号染色体上的微卫星标记BMS1714和INRA61,对其进行遗传多样性研究。结果表明:微卫星标记BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊上呈现多态性。BMS1714基因座有10个等位基因,其片段大小在121138bp之间;BMS1714基因座多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(Ne)、平均杂合度(He)分别为0.714,4.029,0.731。INRA61基因座有11个等位基因,其片段大小在279292bp之间;INRA61基因座的P,C、Ne、He分别为0.776,5.127,0.809。由此表明,微卫星位点BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊上均为高度多态位点,可用于甘肃高山细毛羊的遗传多样性分析。
曾献存[10](2010)在《新疆绵羊遗传多样性及主要经济性状候选基因研究》文中研究指明一.新疆部分绵羊品种遗传多样性分析利用10个微卫星位点对新疆地区7个地方绵羊品种和1个育成品种进行了遗传学检测,初步探讨了新疆8个绵羊品种的遗传多样性和遗传分化关系。结果表明:10个微卫星位点在8个绵羊群体中的平均PIC为0.492,平均He为0.536,其基因多态性和遗传多样性相对贫乏;各个位点GST在0.0170.182之间,平均为0.08;8个绵羊群体FIS在0.2550.556之间,处于较高水平,说明这些绵羊群体内存在一定程度的近交。以中国美利奴(新疆军垦型)羊为外群,UPGMA聚类分析表明,阿勒泰羊、哈萨克羊和巴什拜羊遗传距离较近,首先聚在一起,然后和巴音布鲁克羊聚为一大类;和田羊和策勒黑羊先聚在一起,然后和多浪羊聚为另一大类,这与各绵羊群体的地理分布、起源及育成史基本一致。二.绵羊主要经济性状候选基因的研究1、利用SSCP或RFLP方法,以具有毛品质、生长和繁殖性状差异的中国美利奴羊、德国美利奴羊和德国美利奴羊公羊与中国美利奴羊母羊杂交F1代羊为研究对象,对绵羊羊毛性状(KAP8.2、KAP7、KAP5.4、KAP8.1、KAP1.3和Ⅰ型IF基因)、生长性状(PROP1、POU1F1、IGFBP3和MC4R基因)和繁殖性状(PRLR、RBP4、PGR、FSHβ、GnRHR、BMP4和BMP2基因)候选基因的部分序列进行了多态性检测。结果发现KAP8.1基因、KAP1.3基因、Ⅰ型IF基因、PROP1基因PROP1-1~PROP1-4引物、MC4R基因MC4R-3和MC4R-4引物、PRLR基因PRLR-1和PRLR-2引物和GnRHR基因扩增片段存在多态。2、利用荧光实时定量PCR技术,研究了中国美利奴羊KAP8.1基因、KAP1.3基因、PROP1基因和PRLR基因的表达情况。结果表明中国美利奴羊不同生长阶段(0、7、14、30、60和90日龄)皮肤组织中KAP8.1和KAP1.3基因的发育表达模式基本一致,在0日龄时最高,随后下降。KAP8.1基因表达量在0日龄时高于其他日龄(P<0.01),在14到90日龄间基本趋于平稳状态。KAP1.3基因表达量在0日龄时高于14到90日龄(P<0.01),在7日龄时高于14到90日龄(P<0.05)。PROP1基因仅在绵羊垂体组织中表达,而PRLR基因在绵羊各种组织中广泛表达,且在子宫和下丘脑组织中的表达量最高。垂体组织中的PROP1基因表达量较低,在7日龄时高于30(P<0.01)、14和60日龄(P<0.05),PRLR基因表达量呈现先波动上升后下降的趋势,各日龄间无差异(P>0.05)。PRLR基因表达量在卵巢组织中从7日龄起呈先下降后上升的趋势,90日龄高于030日龄(P<0.05);在睾丸组织中呈波动上升趋势,各日龄间无差异(P>0.05);在皮肤组织中014日龄高于30~90日龄(P<0.01)。3、对KAP8.1、KAP1.3和Ⅰ型IF基因不同基因型与中国美利奴羊羊毛性状进行关联分析,结果显示,KAP1.3基因Bsr I酶切多态性与羊毛细度极显着相关(P<0.01),AA基因型个体羊毛细度低于AB(P<0.05)和BB(P<0.01)基因型个体;KAP8.1基因SSCP多态性与羊毛细度显着相关(P<0.05),BC基因型个体羊毛细度低于AB和BB基因型个体(P<0.05)。KAP8.1和KAP1.3基因组合合并基因型对羊毛细度有显着影响,BC-AA为羊毛细度有利基因型,其个体羊毛细度低于BB-BB、BB-AB、AB-BB和AB-AB基因型个体(P<0.05)。4、PROP1和MC4R基因多态性与中国美利奴羊生长性状的关联分析结果显示: PROP1基因PROP1-4引物扩增片段多态性存在显着的基因型效应,BB基因型为生长性状有利基因型,其个体胸围和胸宽显着高于AA基因型个体(P<0.05),尻宽高于AB基因型个体(P<0.05),体斜长显着高于AA和AB基因型个体(P<0.05);MC4R基因MC4R-4引物扩增片段多态性与体斜长显着相关(P<0.05),BB基因型个体体斜长最大,高于AB、AC和BC基因型个体(P<0.05);PROP1-4和MC4R-4基因组合合并基因型与中国美利奴羊体斜长显着相关(P<0.05),两基因合并效应>单基因效应,合并基因型的效应不是各自基因型效应的简单相加,要高于单个基因型效应。5、利用χ2检验进行中国美利奴羊单胎和多胎个体PRLR-1、PRLR-2和GnRHR引物扩增片段的基因型差异显着性检验,结果表明PRLR-2引物扩增片段AC(P<0.01)和CC(P<0.05)基因型在多胎个体中的频率高于单胎;GnRHR引物扩增片段BB基因型在多胎个体中的频率高于单胎(P<0.01),而AA基因型在多胎个体中的频率低于单胎(P<0.05),推测PRLR-2引物扩增片段AC和CC基因型、GnRHR基因扩增片段BB基因型可能为中国美利奴羊产羔数的有利基因型。6、在中国美利奴羊群体中,对羊毛性状和生长性状候选基因进行合并基因型分析,发现PROP1-4和KAP1.3基因组合合并基因型BB-AA个体胸围、体斜长和体重均最大,且胸围高于合并基因型AA-AA、AB-AA和AA-AB个体(P<0.05)。BB-AA合并基因型对体斜长、胸围和体重的有大的正向遗传贡献率,对羊毛细度的遗传贡献率较小。
二、优质细毛羊遗传多样性的微卫星分析(论文开题报告)
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
本文主要提出一款精简64位RISC处理器存储管理单元结构并详细分析其设计过程。在该MMU结构中,TLB采用叁个分离的TLB,TLB采用基于内容查找的相联存储器并行查找,支持粗粒度为64KB和细粒度为4KB两种页面大小,采用多级分层页表结构映射地址空间,并详细论述了四级页表转换过程,TLB结构组织等。该MMU结构将作为该处理器存储系统实现的一个重要组成部分。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
三、优质细毛羊遗传多样性的微卫星分析(论文提纲范文)
(1)不同品种绵羊D-loop区遗传多样性研究(论文提纲范文)
1 材料与方法 |
1.1 样品采集 |
1.2 提取血液基因组DNA |
1.3 PCR反应 |
1.4 数据分析 |
2 结果与分析 |
2.1 绵羊血液基因组DNA检测及PCR产物扩增结果 |
2.2 测序结果 |
2.3 D-loop序列分析 |
2.4 遗传多样性分析 |
2.5 系统发育树和遗传距离 |
3 讨 论 |
4 结 论 |
(2)利用微卫星分析盐池滩羊核心群体母羊的遗传多样性(论文提纲范文)
摘要 |
Abstract |
第一章 文献综述 |
1.1 滩羊 |
1.1.1 滩羊的外貌 |
1.1.2 滩羊所处的地理环境 |
1.1.3 滩羊的主要产品与地位 |
1.1.4 滩羊面临的问题 |
1.2 微卫星标记 |
1.2.1 微卫星分子标记 |
1.2.2 国内外微卫星的相关应用 |
1.2.3 微卫星在绵羊上的应用 |
1.2.3.1 遗传多样性分析 |
1.2.3.2 构建遗传图谱 |
1.2.3.3 分子标记辅助选择 |
1.2.3.4 杂种优势选择 |
1.2.3.5 亲缘关系鉴定 |
1.3 体重、体尺的意义 |
1.4 本研究的目的与意义 |
第二章 材料与方法 |
2.1 实验材料 |
2.1.1 主要实验试剂 |
2.1.2 主要溶液配制 |
2.1.3 实验仪器 |
2.1.4 样品 |
2.2 实验方法 |
2.2.1 体尺测量、组织样本采集 |
2.2.2 DNA提取 |
2.2.3 微卫星的筛选 |
2.2.4 SSR标记上机检测 |
2.2.5 数据读取与分析 |
2.2.5.1 群体遗传参数统计分析 |
2.2.5.2 Hardy-Weinberg平衡与连锁不平衡 |
2.2.5.3 主坐标分析图 |
2.2.5.4 遗传结构分析 |
2.2.5.5 微卫星位点与体尺性状的关联分析 |
第三章 结果与分析 |
3.1 扩增产物检测结果 |
3.2 遗传多样性分析 |
3.2.1 基因分型结果图 |
3.2.2 微卫星位点的等位基因 |
3.2.3 无效等位基因 |
3.2.4 在滩羊核心母羊群体内微卫星位点的遗传变异水平 |
3.2.5 Hardy-Weinberg平衡与连锁不平衡检测 |
3.3 滩羊群体遗传结构检测 |
3.3.1 滩羊群体内的遗传分布 |
3.3.2 种群遗传结构的分析结果 |
3.4 微卫星标记与体尺的关联 |
3.4.1 滩羊体重、体尺测定 |
3.4.2 微卫星标记与体尺性状的显着性检验结果 |
3.4.3 部分微卫星不同基因型个体间比较的结果 |
第四章 讨论 |
4.1 样本和微卫星选择 |
4.2 微卫星位点的判定 |
4.3 无效等位基因 |
4.4 群体的遗传多样性 |
4.5 群体的遗传结构 |
4.6 体重与体尺数据分析 |
4.7 微卫星与体尺性状的关联分析 |
第五章 结论 |
参考文献 |
致谢 |
个人简介 |
附录 |
(3)微卫星分子标记分析四川绵羊群体遗传多样性(论文提纲范文)
1 材料与方法 |
1.1 实验动物与样品采集 |
1.2 微卫星标记 |
1.3 实验方法 |
1.4 统计分析 |
2 结果 |
2.1 群体内遗传变异 |
2.2 群体间遗传变异 |
2.2.1 遗传距离与聚类关系 |
2.2.3 主成分分析 |
2.2.4 分子方差分析 |
3 讨论 |
3.1 群体内遗传多样性 |
3.2 群体间遗传多样性 |
4 小结 |
(4)微卫星标记在动物遗传多样性分析的研究进展(论文提纲范文)
1 微卫星的结构和遗传特性 |
2 微卫星优点 |
3 遗传多样性内容和分析方法 |
4 微卫星在不同动物遗传多样性分析的应用 |
4.1 猪 |
4.2 马 |
4.3 牛 |
4.4 羊 |
4.5 鹿 |
5 展望 |
(5)中国细毛羊群体遗传多样性分析(论文提纲范文)
摘要 |
Summary |
目录 |
英文缩略 |
第一章 前言 |
1.1 绵羊起源及我国品种资源概况 |
1.1.1 绵羊在系统分类学中的地位 |
1.1.2 绵羊的起源与驯化 |
1.1.3 中国绵羊遗传资源概况 |
1.2 国内外细毛羊发展趋势 |
1.2.1 世界羊毛市场呈现供求紧张状况 |
1.2.2 世界毛纺织业逐渐向发展中国家转移 |
1.2.3 世界细羊毛品质向“超细”毛方向发展 |
1.2.4 我国细毛羊产业发展概况 |
1.3 本研究涉及的主要绵羊品种 |
1.3.1 中国美利奴羊(Chinese Merino) |
1.3.2 敖汉细毛羊(Aohan Merino) |
1.3.3 甘肃高山细毛羊(Gansu Alpine Merino) |
1.3.4 新吉细毛羊(Xinji Merino) |
1.3.5 青海细毛羊(Qinghai Merino) |
1.3.6 凉山半细毛羊(Liangshan Semi-fine-wool sheep) |
1.3.7 湖羊(Hu sheep) |
1.4 绵羊微卫星的研究 |
1.4.1 国内绵羊微卫星研究 |
1.4.2 国外绵羊微卫星研究 |
1.5 本研究目的与意义 |
第二章 试验材料与方法 |
2.1 试验材料 |
2.1.1 样本信息 |
2.1.2 主要仪器设备 |
2.1.3 主要试剂 |
2.1.4 主要试剂配制 |
2.2 试验方法 |
2.2.1 DNA 提取 |
2.2.2 微卫星引物 |
2.2.3 PCR 扩增反应体系及条件 |
2.2.4 PCR 扩增产物检测 |
2.2.5 微卫星 DNA 多态性分析 |
2.4 统计分析 |
2.4.1. 连锁不平衡检验 |
2.4.2 遗传多样性分析 |
2.4.3 哈代—温伯格平衡检验 |
2.4.4 遗传分化分析 |
2.4.5 系统发育分析 |
第三章 结果与分析 |
3.1 基因组 DNA 提取结果 |
3.2 ABI3730XL 检测结果 |
3.3 连锁不平衡检验 |
3.4 等位基因数目和频率 |
3.4.1 等位基因数目变异 |
3.4.2 等位基因频率变异 |
3.5 平均等位基因数、等位基因丰富度 |
3.6 期望遗传杂合度和观测遗传杂合度 |
3.7 多态信息含量 |
3.8 遗传分化系数和基因流 |
3.9 哈代—温伯格平衡检验 |
3.10 系统发育分析 |
3.10.1 遗传距离 |
3.10.2 系统发育树的构建 |
3.11 主成分分析 |
3.12 群体遗传结构推导 |
第四章 讨论 |
4.1 哈代-温伯格平衡检验 |
4.2 细毛羊群体的遗传多样性 |
4.3 绵羊群体间的遗传关系 |
4.3.1 F-统计量与基因流 |
4.3.2 遗传距离 |
4.3.3 聚类分析 |
第五章 结论 |
附录 |
附录 1. 中国美利奴羊(Chinese Merino) |
附录 2. 主要仪器设备 |
附录 3. 主要试剂 |
附录 4. 主要试剂配制 |
附录 5. DNA 提取 |
附录 6. PCR 扩增产物检测 |
附录 7. 微卫星 DNA 多态性分析 |
附录 8 10 个位点的连锁不平衡检验 |
参考文献 |
作者简历 |
导师简介 |
致谢 |
(6)甘肃高山细毛羊超细毛型品系微卫星BMS1714和INRA61的遗传多样性分析(论文提纲范文)
1 材料 |
1.1 样品采集 |
1.2 主要试剂及仪器 |
2 方法 |
2.1 基因组DNA的提取 |
2.2 引物设计 |
2.3 PCR反应条件 |
2.4 扩增产物的检测及基因分型 |
2.5 统计分析 |
3 结果与分析 |
3.1 微卫星标记检测结果 |
3.2 微卫星座位的等位基因频率和基因型频率 |
3.3 微卫星位点的有效等位基因数、群体杂合度及多态信息含量 |
4 讨论 |
(7)甘肃高山细毛羊微卫星遗传多样性及亲子鉴定研究(论文提纲范文)
1. 结果与分析 |
1.1 等位基因变异分析 |
1.2 Hardy-Weinberg平衡检验 |
1.3 杂合度、多态信息含量 |
1.4 父权排除率 |
1.5 鉴定结果 |
2 讨论 |
2.1 微卫星座位的遗传多样性 |
2.2 亲子鉴定结果 |
3. 材料与方法 |
3.1 实验材料 |
3.2 实验方法 |
3.2.1 DNA提取 |
3.2.2 微卫星标记 |
3.2.3 产物检测及亲权鉴定 |
(9)微卫星标记BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊中的遗传多样性研究(论文提纲范文)
1 材料 |
1.1 样品采集 |
1.2 主要仪器及试剂 |
2 方法 |
2.1 基因组DNA的提取 |
2.2 引物的设计 |
2.3 PCR反应条件 |
2.4 扩增产物的检测及电泳分型 |
2.5 统计分析 |
3 结果与分析 |
4 讨论 |
(10)新疆绵羊遗传多样性及主要经济性状候选基因研究(论文提纲范文)
中文摘要 |
Abstract |
缩写的中英文对照 |
第一章 文献综述 |
1. 微卫星标记在绵羊遗传多样性研究中的应用 |
1.1 新疆地区绵羊遗传资源现状 |
1.2 遗传多样性的概念及其研究意义 |
1.3 微卫星标记在绵羊遗传多样性研究中的应用 |
2. 绵羊角蛋白基因的研究进展 |
2.1 角蛋白的分类 |
2.2 角蛋白基因的表达分析 |
2.3 角蛋白基因多态性及与羊毛性状的关联分析 |
3. 绵羊生长性状相关基因的研究进展 |
3.1 垂体特异性转录因子祖先蛋白(PROP1)基因 |
3.2 垂体转录因子(POU1F1)基因 |
3.3 黑素皮质素受体-4(MC4R)基因 |
3.4 胰岛素样生长因子结合蛋白(IGFBP3)基因 |
4. 绵羊繁殖性状相关甚因的研究进展 |
4.1 催乳素受体基因 |
4.2 促性腺激素释放激素(GnRH)及受体基因 |
4.3 视黄醇结合蛋白4(RBP4)基因 |
4.4 骨形态发生蛋白基因 |
5. 多基因聚合在动物育种中应用 |
5.1 聚合育种的概念和基本原理 |
5.2 聚合育种在畜禽育种中的研究进展 |
5.3 动物基因聚合育种的问题和展望 |
第二章 新疆部分绵羊品种遗传多样性分析 |
1. 材料和方法 |
1.1 材料 |
1.2 试验方法 |
1.3 数据处理及统计分析 |
2. 结果与分析 |
2.1 微卫星座位多样性 |
2.2 群体遗传多样性 |
2.3 绵羊群体之间遗传距离及系统发生分析 |
3. 讨论 |
第三章 绵羊部分角蛋白基因多态性的检测 |
1. 材料和方法 |
1.1 材料 |
1.2 试验方法 |
1.3 数据处理及统计分析 |
2. 结果与分析 |
2.1 扩增片段RFLP 或SSCP 检测结果 |
2.2 各多态位点的等位基因频率和基因型频率 |
3. 讨论 |
第四章 绵羊生长性状部分候选基因多态性的检测 |
1. 材料和方法 |
1.1 材料 |
1.2 试验方法 |
1.3 数据处理及统计分析 |
2. 结果与分析 |
2.1 PROP1 基因 |
2.2 POU1F1 基因和IGFBP3 基因SSCP 检测结果 |
2.3 MC4R 基因 |
3. 讨论 |
3.1 关于SSCP 分析 |
3.2 绵羊PROP1 基因的单核甘酸多态性 |
3.3 绵羊POU1F1 和IGFBP3 基因的多态性 |
3.4 绵羊MC4R 基因的多态性 |
第五章 绵羊繁殖性状部分候选基因多态性的检测 |
1. 材料和方法 |
1.1 材料 |
1.2 试验方法 |
1.3 数据处理及统计分析 |
2. 结果与分析 |
2.1 扩增片段SSCP 检测结果 |
2.2 各多态位点的等位基因和基因型频率 |
3. 讨论 |
第六章 KAP8.1 和KAP1.3 基因在中国美利奴羊不同生长阶段皮肤组织中表达规律的研究 |
1. 材料和方法 |
1.1 材料 |
1.2 试验方法 |
1.3 数据分析 |
2. 结果与分析 |
2.1 绵羊KAP8.1、KAP1.3 和β-actin 基因的PCR 扩增 |
2.2 KAP8.1、KAP1.3 和β-actin 基因的标准曲线及融解曲线 |
2.3 不同生长阶段皮肤组织中KAP8.1 和KAP1.3 基因的相对表达量 |
3. 讨论 |
第七章 PROP1 和PRLR 基因在中国美利奴羊不同生长阶段表达规律的研究 |
1. 材料与方法 |
1.1 材料 |
1.2 试验方法 |
1.3 数据分析 |
2. 结果与分析 |
2.1 绵羊PROP1、PRLR 和β-actin 基因的PCR 扩增 |
2.2 PROP1 和PRLR 基因的标准曲线及融解曲线 |
2.3 绵羊PROP1 和PRLR 基因组织表达谱分析 |
2.4 不同生长阶段垂体组织中PROP1 和PRLR 基因的相对表达量 |
2.5 不同生长阶段卵巢、睾丸和皮肤组织中PRLR 基因的相对表达量 |
3. 讨论 |
第八章 Ⅰ型IF、KAP1.3 和KAP8.1 基因多态性与中国美利奴羊羊毛性状的关联分析 |
1. 材料和方法 |
1.1 材料 |
1.2 试验方法 |
1.3 数据处理及统计分析 |
2. 结果与分析 |
2.1 各多态位点基因型与中国美利奴羊羊毛性状的关联分析 |
2.2 KAP8.1 和KAP1.3 基因组合不同合并基因型与中国美利奴羊羊毛性状的关系 |
3. 讨论 |
3.1 中国美利奴羊Ⅰ型IF、KAP1.3 和KAP8.1 基因的多态性与羊毛性状的关系 |
3.2 KAP8.1 和KAP1.3 基因组合合并基因型对中国美利奴羊羊毛性状的基因效应 |
第九章 PROP1 和MC4R 基因多态性与中国美利奴羊生长性状的关联分析 |
1. 材料和方法 |
1.1 材料 |
1.2 试验方法 |
1.3 数据处理及统计分析 |
2. 结果与分析 |
2.1 PROP1 基因多态性与中国美利奴羊生长性状的关联分析 |
2.2 MC4R 基因多态性与中国美利奴羊生长性状的关联分析 |
2.3 PROP1-4 和MC4R-4 位点合并基因型与中国美利奴羊生长性状的关系 |
3. 讨论 |
3.1 绵羊PROP1 基因单核甘酸多态性的基因型效应分析 |
3.2 绵羊MC4R 基因的多态性的基因型效应分析 |
3.3 PROP1-4和MC4R-4位点组合合并基因型对中国美利奴羊生长性状的基因效应 |
第十章 PRLR 和GnRHR 基因多态性与中国美利奴羊产羔数的关联分析 |
1. 材料和方法 |
1.1 材料 |
1.2 试验方法 |
1.3 数据处理及统计分析 |
2. 结果与分析 |
2.1 PRLR 基因多态性与中国美利奴羊产羔数的关联分析 |
2.2 GnRHR 基因多态性与中国美利奴羊产羔数的关联分析00 |
3. 讨论 |
第十一章 绵羊多经济性状基因聚合的初步探讨 |
1. 材料和方法 |
1.1 材料 |
1.2 试验方法 |
1.3 数据处理及统计分析 |
2. 结果与分析 |
2.1 中国美利奴羊PROP1-4 和KAP1.3、MC4R-4 和KAP1.3 组合的基因型效应 |
2.2 中国美利奴羊PROP1-4 和KAP1.3、MC4R-4 和KAP1.3 组合不同合并基因型对经济性状的贡献率 |
2.3 F1 代羊PROP1-4 和KAP1.3、MC4R-4 和KAP1.3 组合基因型频率 |
3. 讨论 |
全文总结 |
创新点 |
参考文献 |
附录 |
致谢 |
作者简介 |
在学校期间参与的研究课题 |
博士期间发表论文(第一作者) |
四、优质细毛羊遗传多样性的微卫星分析(论文参考文献)
- [1]不同品种绵羊D-loop区遗传多样性研究[J]. 肖帆,张利平,朗侠,吴建平,张筱艳,靳继鹏. 西北农业学报, 2021(08)
- [2]利用微卫星分析盐池滩羊核心群体母羊的遗传多样性[D]. 李标. 宁夏大学, 2019(02)
- [3]微卫星分子标记分析四川绵羊群体遗传多样性[J]. 王婷,吴登俊. 中国畜牧杂志, 2018(04)
- [4]微卫星标记在动物遗传多样性分析的研究进展[J]. 张正义,邢秀梅,胡鹏飞,刘松啸,董依萌,鞠贵春. 经济动物学报, 2017(03)
- [5]中国细毛羊群体遗传多样性分析[D]. 杨敏. 甘肃农业大学, 2014(05)
- [6]甘肃高山细毛羊超细毛型品系微卫星BMS1714和INRA61的遗传多样性分析[J]. 郭婷婷,杨博辉,郭健,牛春娥,岳耀敬,孙晓萍,冯瑞林,刘建斌. 中国草食动物科学, 2013(02)
- [7]甘肃高山细毛羊微卫星遗传多样性及亲子鉴定研究[J]. 李洁,罗玉柱,李少斌,刘秀,成述儒. 农业生物技术学报, 2013(02)
- [8]微卫星标记BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊中的遗传多样性研究[A]. 郭婷婷,杨博辉,郭健,牛春娥,岳耀敬,孙晓萍,冯瑞林,刘建斌. 中国畜牧兽医学会养羊学分会2012年全国养羊生产与学术研讨会议论文集, 2012
- [9]微卫星标记BMS1714和INRA61在甘肃高山细毛羊中的遗传多样性研究[J]. 郭婷婷,杨博辉,郭健,牛春娥,岳耀敬,孙晓萍,冯瑞林,刘建斌. 中国草食动物科学, 2012(S1)
- [10]新疆绵羊遗传多样性及主要经济性状候选基因研究[D]. 曾献存. 石河子大学, 2010(01)